干细胞之家 - 中国干细胞行业门户第一站

标题: 扩增质粒时的摇菌问题 [打印本页]

作者: pla269    时间: 2011-7-9 22:15     标题: 扩增质粒时的摇菌问题

大家在扩增质粒(大提)的过程中,为了提高得率,摇菌时一般有什么具体办法?先用15ml离心管摇菌时用多少LB培养基,多少菌,摇多长时间?然后往大瓶里放多少菌,摇多长时间?大家指教一下
作者: Temin    时间: 2011-7-9 22:39

我们喜欢用可以透气的摇菌管,有种BD的大概15ML的管子,具体货号不记得,它能透气,让E.coli长的密度高一些。加入的LB在5ML左右就可以。你说大抽的话,我建议用50ML管子菌液会多些,可以摇菌20ML。也可以用透气瓶盖的三角瓶,可以摇菌50ML-200ML不等,看你需要的量了。总之,我认为要得到多的质粒,就需要多的菌液,所以觉得透气培养比较好。至于接种密度和摇菌时间,我们一般按照1/20左右接菌,就是500UL接菌10ML LB培养基,摇菌过夜(16小时左右)。希望能对你有所参考作用。
作者: lemma710    时间: 2011-7-9 23:47

大抽的话我一般都用大的锥形瓶的,瓶口用纱布封紧。摇菌最好不要超过16h,过了菌会老。加菌我按1:1000加,1ML+1UL的菌。大抽质粒太多了也不一定好,它柱子都是有一定的吸附能力的,而且裂解的时候菌太多了会裂解不完全,这些都会影响抽出质粒的量的。试剂盒里应该有建议的菌的量的吧。
作者: pla269    时间: 2011-7-10 01:59

回复 Temin 的帖子
- p$ {( v0 n! ]  ^, |5 a! _/ X! x
' Q  I% S2 G9 T有的技师说摇4-5小时就行了,不然死菌太多,菌的生长也受抑制了,也有人强调要过夜摇菌,你怎么判断菌量啊?
作者: 痞子的烟头    时间: 2011-7-10 08:06

正常是先挑菌落,于15或20的玻璃管内 5ml LB摇过夜,第二天,将5ML倒入250MLLB中,再摇过夜,基本上就可以了,提的量绝对够!注意均要加入抗生素,
作者: pla269    时间: 2011-7-10 08:26

回复 痞子的烟头 的帖子
: t) r0 N( G7 Q' s' l" w; F: V1 `' k
你是怎么判断菌量的
作者: Temin    时间: 2011-7-10 08:33

回复 pla269 的帖子3 C, M. n4 d5 Z8 k' r& F

( m$ [( S- l7 J$ A我们正常的流程是:8 M8 c: o( i' z
第一天,下班之前也就是5点钟接菌,37度震荡培养;
; E+ x! u) s, C. h) X" v第二天,上班的时候(9点钟)收菌,培养的时间也就是16小时左右。8 d: ?5 B3 a( o% g) @$ p5 f" O
基本上是目测判断菌量的多少,很久没有测定过菌液的OD值,我忘了是0.6-0.8还是多少,你可以自己查一查分子克隆手册。凭着经验,看起来比较浑浊就差不多了,因为我提取质粒一般是用作细胞转染,按照我们以往的实验,都是大致这样的流程,所以没有很细致的去研究这个。
- I0 Z1 ]8 z/ W" T摇菌4-5小时的话,在我们这边不大合适,因为这样接下来还得抽提质粒和验证质粒需要花费2-3小时,那样一个工作日就排满了,有可能做不完还得加班。
2 M) i6 m! S/ t9 t( \. I我觉得在基础实验这一块,尤其是商品化试剂盒非常成熟的基本实验技术,第一次第二次认真参考实验手册,这样你就会得到自己的判断,如果只是简单的得到质粒作为后续研究使用,你大可不必拘泥于实验手册,毕竟每种菌、每种质粒有自己的特性,怎么方便实验流程怎么来。
作者: jun8013    时间: 2011-7-10 08:50

回复 pla269 的帖子; P1 U3 w& }2 O5 z( B7 y& n
! O8 B! O  T8 O# y) w. z4 _) x
测OD值,我们一般锥形瓶,100ml 1%接种量,你说的4-5小时应该是在对数期,OD应该在0.4-1.0之间,抽提质粒,我们一般是过夜培养12h即可,有时8-10小时。没有必要那么准确,主要是在你后面solution I II  III与你菌体比例要做好,你的抽提试剂盒上应该有写
作者: susanliuxue    时间: 2011-7-11 07:22

为了提高得率,先用15ml离心管3mlLB培养基摇菌过夜,然后吸取100ul去大摇过夜。
作者: huangcong1988    时间: 2011-11-30 20:39

其实摇菌的多少,要看你所用的试剂盒,你如果是大提的话,一般必须得100ml LB以上,所以,你只能用锥形瓶;如果中提的话(50~100ml菌液就行),你还是得用锥形瓶,因为一般的离心管都盛不了那么多的LB,有人想用50ml离心管摇50ml菌,这个是很不可取的,因为50ml管虽然可以盛下55ml左右菌液,但是加了50ml lb后,瓶子里面就没什么空间了,这样很不利于菌的生长,另外,这样摇菌的话也摇得不均匀;如果是小提的话(10ml就够了),那么用50ml离心管就行了。菌液是否摇好主要看其浑浊程度,有些人说摇菌时间太长会长杂菌什么的,我暂时还没有过,不过我个人觉得摇菌最后就是直接摇菌过夜,摇完之后如果有事不能立即提,可以拿出来放4度,那样菌液还是可以保存一段时间的
作者: 懵懂干细胞    时间: 2011-11-30 21:15

回复 痞子的烟头 的帖子$ O7 W  o+ j0 O, K  N9 W8 P
0 w9 S3 O  o. r$ G5 B- X
先在小管里面摇4-5小时在接大瓶的话是可以的!
6 g" x# l  K: ?2 k* @提质粒的话可以摇菌多一点,看配液的浑浊度吧!
" X/ Y) X/ K; ^% E3 m中间可以保菌一下!保菌的话为了保证菌的活力你可以离心收集一下再保!
作者: wangyashuai    时间: 2011-11-30 23:01

摇菌时间主要与你的抗生素有关,氨苄和卡那霉素因为细菌的分解机理不同,一个是吸收进菌体内部作用,可以多摇一下,一般不超过16个小时,另一个是细菌分泌蛋白到细胞外,外界抗生素浓度会很快下降,摇菌时间不能超过12小时,否则就可能长杂菌。
作者: lingling    时间: 2015-4-1 21:04

回复 痞子的烟头 的帖子
, |) N. L7 ]" E. U5 f, s4 i# j  e: a% I
你好,我想问下:“正常是先挑菌落,于15或20的玻璃管内 5ml LB摇过夜,第二天,将5ML倒入250MLLB中,再摇过夜”这里第二天你是把5mlLB倒入250MLLB中放4°C等下午5点再摇过夜吗?还是直接把已摇过夜5ml LB放在4°C下午5点再倒入250MLLB中,再摇过夜?
作者: 妖妖空    时间: 2015-4-1 22:41

培养一般都是12hr的,我们都是1:100接菌的,有时候需要考虑质粒的类型的,高拷贝还是低拷贝。低拷贝的有专门的处理方法。
作者: 细胞海洋    时间: 2015-4-2 07:48

回复 lingling 的帖子
- g# s# Z& t3 q8 I8 J/ M* ?1 {4 A2 t# M% B/ P/ Y
建议你发新帖提问
作者: lingling    时间: 2015-4-2 08:13

谢谢




欢迎光临 干细胞之家 - 中国干细胞行业门户第一站 (http://stemcell8.cn./) Powered by Discuz! X1.5