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mRNA的表达量与Western blot检测的一致性   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2012-6-6 17:09 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
大家有没有碰到过这样的情况,检测某基因的表达量时,qRT-PCR和Western blot检测不一致?
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沙发
发表于 2012-6-6 19:07 |只看该作者
有的,有篇文章上检测sox2在小鼠睾丸上的表达,RNA很强,蛋白没有。
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藤椅
发表于 2012-6-6 23:10 |只看该作者
转录后需要翻译才能产生蛋白,而翻译受很多因素调控,因此两者不一致是有可能的
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板凳
发表于 2012-6-6 23:36 |只看该作者
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回复 xiaomao_zhoubo 的帖子
( @! n5 k/ s. |  \! d! \5 C/ M& P: s5 n
呵呵,我再加一句,miRNA不需要翻译成蛋白,所以qRT-PCR用来检测miRNA的表达效果是可信的,检测某基因的表达却不一定可信。
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报纸
发表于 2012-6-7 09:27 |只看该作者
回复 燕北飞 的帖子: D! V3 K) o7 E6 w

) F9 Z: S% h% F- R  h, p9 r您的意思是miRNA在RNA水平和蛋白水平不可比?
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地板
发表于 2012-6-7 09:40 |只看该作者
miRNA属于非编码RNA,以RNA形式就发挥功能了呀。
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发表于 2012-6-7 14:35 |只看该作者
回复 minshuyin 的帖子1 [& |7 R9 W: n; L: ]  n# A

( L, Z% C. q% q  U; F9 s( c8 f  @是mRNA与蛋白水平很多情况下是不一致的。miRNA只有RNA水平,没有蛋白水平。
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金话筒 优秀会员

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发表于 2012-6-7 15:35 |只看该作者
真正起功能的是蛋白,由于mRNA转录出来受miRNA调控和其他修饰的调控,因此mRNA不一定翻译为蛋白,功能蛋白检测蛋白表达水平结果更可信(miRNA除外)。
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发表于 2012-6-9 09:20 |只看该作者
回复 燕北飞 的帖子0 S8 l, F# Y, @) ~1 C2 M

! g! y2 s, x2 u5 U是的,但是很多人做miRNA实验,发表的论文中经常会有mRNA水平变化不大,蛋白水平差异明显啊。
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发表于 2012-6-10 20:00 |只看该作者
回复 minshuyin 的帖子
$ I, e& V) R) t# X( Q( R/ ?% U
9 {8 z& V. i% g6 k% S你说的这个是miRNA的调控方式问题,从miRNA沉默靶基因mRNA的方式上分析,miRNA不会降低靶基因mRNA的水平,只能沉静蛋白表达,我个人不认同很多文献里细胞实验的结果。感觉改变miRNA水平后的细胞拿来做基因芯片筛选靶基因的方式不可信!
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