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关于转基因小鼠的鉴定问题,急! [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2015-12-28 17:24 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
我向别人要了杂合的ROSA lacZ/EGFP转基因小鼠,和野生小鼠杂交繁殖,有两对引物用来鉴定,一对是内参引物,另外一对是针对EGFP设计的引物,目的基因长173bp,每次pcr鉴定都只能扩增出内参引物,就是得不到目的基因,有哪位大侠给点建议,现在有5笼小鼠继续鉴定,着急中。
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金话筒 帅哥研究员 优秀会员

沙发
发表于 2015-12-28 19:02 |只看该作者
这种事情经常见,很令人头痛。有个问题是:你是两对引物一起P,还是每对引物单独P,如果一起P,两对引物的退火温度一样吗?" x2 d, L0 B. q* s& \8 [1 t
还有就是你单独P那个EGFP能P出来吗?P的时候一定要做好各种对照。就是说已经明确鉴定过的EGFP小鼠DNA,还有不带EGFP的小鼠的DNA。还有P不出来是因为这种小鼠就是没有EGFP。
7 V7 Y1 W- Z5 h' M3 ^. l( R' _" r. S; t  m
最笨的解决方案:首先是确定PCR用的酶、buffer、dNTP都没有问题,然后就是确保引物序列没有合成错误。剩下的就是痛苦的PCR条件摸排了,比如退火温度,最好是梯度温度,还有PCR时间。  s% l, J0 q* o+ R- e( s
有的时候还要加DMSO等帮助PCR。
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藤椅
发表于 2015-12-29 17:17 |只看该作者
非常感谢moluxingke这位仁兄,我用的是2x的Mix,用了四种,退火温度也试过很多次,后来都只做阳性对照了,不管分开还是一起扩增,都是只有内参,目的基因的引物序列是没有问题的,我自己也设计了,得到相同的序列。实在没有办法了,现在换了一家公司,重新合成引物看看。不过我从来没用过DMSO,我也试试。继续奋斗!
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小小研究员

板凳
发表于 2015-12-30 11:02 |只看该作者
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回复 hxf 的帖子
% k! V, P) \; S1 d9 B' L5 I* @* k: Q4 v: g
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5 I6 Q/ {% ^# ?! Z( g$ b
否则他会看不到

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报纸
发表于 2015-12-31 17:05 |只看该作者
回复 moluxingke 的帖子) y( l/ D' U- c" m$ T
' R# o* {; Y9 z
非常感谢moluxingke,我用的是2x的Mix,用了四种,退火温度也试过很多次,后来都只做阳性对照了,不管分开还是一起扩增,都是只有内参,目的基因的引物序列是没有问题的,我自己也设计了,得到相同的序列。实在没有办法了,现在换了一家公司,重新合成引物看看。不过我从来没用过DMSO,我也试试。继续奋斗!
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地板
发表于 2015-12-31 17:06 |只看该作者
回复 细胞海洋 的帖子# a5 S1 l4 j; J/ h
7 V  B  ~+ r% P9 x& ^
谢谢,懂了
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