有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家
6 x6 J! D' B8 b( W. z1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？
: ^2 P) X8 C; [% J9 g# h2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？6 o2 A0 m, N' k5 S: n4 `+ g
3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。' L0 X# s  b+ v/ K) a3 x; i
4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？  a/ ^, e$ R0 y. k( X) N3 r; [: Z

( U  ^; U5 m# A$ u多谢！
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1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。4 B% q. m; U1 u9 |# H. v$ e
2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。
4 }, d3 |( I  V! y. c6 N; d5 B3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。3 H8 B! L2 J+ R% A- D
4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。