有关慢病毒感染后对细胞的鉴定

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我有几个问题想请教大家& p3 r2 [( y( W, q* O" e
1）lentivirus感染细胞，整合的序列是哪部分？是从目的基因载体的LTR到LTR？还是也包含包装质粒部分呢？: r* g, I4 ~( Q
2）为什么可以提取被感染细胞的基因组来检测病毒整合情况？是因为目的基因直接整合，不存在内含子的问题么？: p: C/ a/ u1 h
3）有的人用RT-PCR来做，是为什么呢？如果提取基因组就可以检测的话。
7 k, @5 j$ ^+ u' Q$ Y: n4）还有一个问题，如果我提取基因组，我的引物可不可以上游是载体序列，下游是基因序列？2 Z7 p+ i5 i8 V2 Z  E* E% v

; _1 L- }' R2 ]6 H多谢！3 Q8 x* F  P5 F, O! U' j

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1.lentivirus 其表达载体5'LTR到3‘LTR的序列整合到宿主基因组中成为前病毒基因组，并不含有辅助包装的遗传物质，否则就成了野生型病毒。
7 z- b+ F% k4 `( @7 [2.提取基因组的目的是为了做定性检测病毒基因组是否整合。
9 D+ q, V, e, ^/ u  p7 `& V- ^" G3.realtime 的目的是检测目的基因在宿主中的表达水平。& H' M$ x  o% S6 E% y
4.引物设计时你要充分考虑你的引物特异性，既目的基因中选取的片段是否有非特异性结合。